Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IMPG1Q17R60 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IMPG1Q17R60 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms