Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPP1Q16831 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPP1Q16831 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms