Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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PTPROQ16827 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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PTPROQ16827 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTPROQ16827 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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