Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPE65Q16518 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
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RPE65Q16518 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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RPE65Q16518 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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RPE65Q16518 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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RPE65Q16518 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPE65Q16518 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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