Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NPTX1Q15818 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NPTX1Q15818 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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