Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TCEA2Q15560 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms