Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18Q15532 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18Q15532 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18Q15532 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18Q15532 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18Q15532 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18Q15532 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18Q15532 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18Q15532 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18Q15532 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18Q15532 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18Q15532 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18Q15532 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18Q15532 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18Q15532 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18Q15532 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18Q15532 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18Q15532 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18Q15532 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18Q15532 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18Q15532 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18Q15532 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18Q15532 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18Q15532 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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SS18Q15532 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18Q15532 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SS18Q15532 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18Q15532 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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SS18Q15532 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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SS18Q15532 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SS18Q15532 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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SS18Q15532 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18Q15532 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SS18Q15532 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18Q15532 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18Q15532 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18Q15532 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18Q15532 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18Q15532 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18Q15532 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SS18Q15532 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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