Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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SEC23BQ15437 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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SEC23BQ15437 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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SEC23BQ15437 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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SEC23BQ15437 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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SEC23BQ15437 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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SEC23BQ15437 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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