Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NR6A1Q15406 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NR6A1Q15406 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms