Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDGFRLQ15198 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PDGFRLQ15198 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms