Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAM2Q15035 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms