Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SQLEQ14534 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
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