Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCARF1Q14162 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCARF1Q14162 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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