Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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