Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CBFBQ13951 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms