Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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