Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C1orf61Q13536 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf61Q13536 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms