Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRPF4BQ13523 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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PRPF4BQ13523 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRPF4BQ13523 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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