Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
XRCC4Q13426 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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