Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATMQ13315 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATMQ13315 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATMQ13315 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATMQ13315 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATMQ13315 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATMQ13315 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATMQ13315 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATMQ13315 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATMQ13315 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATMQ13315 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATMQ13315 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATMQ13315 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATMQ13315 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATMQ13315 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATMQ13315 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATMQ13315 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATMQ13315 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATMQ13315 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATMQ13315 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATMQ13315 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATMQ13315 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATMQ13315 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATMQ13315 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATMQ13315 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATMQ13315 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATMQ13315 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATMQ13315 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATMQ13315 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATMQ13315 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATMQ13315 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATMQ13315 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATMQ13315 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATMQ13315 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATMQ13315 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATMQ13315 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATMQ13315 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATMQ13315 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATMQ13315 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATMQ13315 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATMQ13315 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATMQ13315 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATMQ13315 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATMQ13315 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATMQ13315 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ATMQ13315 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATMQ13315 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ATMQ13315 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ATMQ13315 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATMQ13315 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATMQ13315 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATMQ13315 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATMQ13315 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATMQ13315 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATMQ13315 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATMQ13315 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATMQ13315 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATMQ13315 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATMQ13315 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATMQ13315 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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