Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GRIN2BQ13224 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GRIN2BQ13224 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
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