Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLFQ13129 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLFQ13129 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLFQ13129 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLFQ13129 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLFQ13129 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLFQ13129 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLFQ13129 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLFQ13129 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLFQ13129 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLFQ13129 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLFQ13129 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLFQ13129 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLFQ13129 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLFQ13129 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLFQ13129 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLFQ13129 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLFQ13129 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLFQ13129 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLFQ13129 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLFQ13129 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLFQ13129 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLFQ13129 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLFQ13129 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLFQ13129 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLFQ13129 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLFQ13129 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLFQ13129 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLFQ13129 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLFQ13129 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLFQ13129 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLFQ13129 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLFQ13129 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLFQ13129 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLFQ13129 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLFQ13129 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLFQ13129 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLFQ13129 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLFQ13129 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLFQ13129 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLFQ13129 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLFQ13129 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLFQ13129 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLFQ13129 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLFQ13129 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RLFQ13129 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RLFQ13129 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RLFQ13129 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RLFQ13129 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RLFQ13129 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RLFQ13129 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RLFQ13129 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLFQ13129 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLFQ13129 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLFQ13129 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLFQ13129 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLFQ13129 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLFQ13129 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLFQ13129 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLFQ13129 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLFQ13129 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RLFQ13129 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLFQ13129 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLFQ13129 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLFQ13129 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLFQ13129 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLFQ13129 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLFQ13129 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLFQ13129 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLFQ13129 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLFQ13129 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLFQ13129 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLFQ13129 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLFQ13129 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLFQ13129 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLFQ13129 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RLFQ13129 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLFQ13129 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLFQ13129 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLFQ13129 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLFQ13129 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RLFQ13129 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLFQ13129 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLFQ13129 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLFQ13129 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLFQ13129 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLFQ13129 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLFQ13129 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLFQ13129 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RLFQ13129 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RLFQ13129 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RLFQ13129 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RLFQ13129 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RLFQ13129 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RLFQ13129 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RLFQ13129 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RLFQ13129 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RLFQ13129 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RLFQ13129 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RLFQ13129 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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