Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IFT88Q13099 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IFT88Q13099 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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