Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF1Q13077 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms