Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK3Q13003 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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