Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIK2Q13002 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms