Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPSF1Q10570 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPSF1Q10570 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
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