Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CD300CQ08708 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms