Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DSC1Q08554 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DSC1Q08554 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms