Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CACNG1Q06432 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms