Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPN11Q06124 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPN11Q06124 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms