Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIN1Q05586 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIN1Q05586 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms