Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPN12Q05209 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN12Q05209 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms