Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
UBXN1Q04323 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
UBXN1Q04323 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms