Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 RFC3P1-201ENST00000454568 682 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 IL31RA-208ENST00000611895 1171 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 CEP41-203ENST00000343969 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 AC109466.1-206ENST00000522686 774 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 ZNF506-204ENST00000545006 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 ZNF585A-205ENST00000588354 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNB1Q02641 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 MGST3-202ENST00000367884 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNB1Q02641 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms