Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DSC2Q02487 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSC2Q02487 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms