Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
BNC1Q01954 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BNC1Q01954 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms