Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF9Q00978 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms