Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNA1BQ00975 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CACNA1BQ00975 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms