Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRB1P82279 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CRB1P82279 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRB1P82279 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRB1P82279 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRB1P82279 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRB1P82279 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRB1P82279 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRB1P82279 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRB1P82279 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRB1P82279 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRB1P82279 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRB1P82279 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRB1P82279 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRB1P82279 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRB1P82279 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CRB1P82279 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRB1P82279 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRB1P82279 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRB1P82279 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRB1P82279 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRB1P82279 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRB1P82279 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRB1P82279 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CRB1P82279 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRB1P82279 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRB1P82279 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRB1P82279 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRB1P82279 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRB1P82279 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CRB1P82279 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRB1P82279 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CRB1P82279 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CRB1P82279 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRB1P82279 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRB1P82279 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CRB1P82279 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CRB1P82279 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRB1P82279 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRB1P82279 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CRB1P82279 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRB1P82279 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRB1P82279 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRB1P82279 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRB1P82279 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRB1P82279 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRB1P82279 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRB1P82279 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRB1P82279 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRB1P82279 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRB1P82279 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRB1P82279 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRB1P82279 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRB1P82279 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRB1P82279 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRB1P82279 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRB1P82279 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRB1P82279 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRB1P82279 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRB1P82279 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRB1P82279 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRB1P82279 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CRB1P82279 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRB1P82279 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRB1P82279 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRB1P82279 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRB1P82279 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRB1P82279 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRB1P82279 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRB1P82279 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRB1P82279 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms