Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX3P78415 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX3P78415 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX3P78415 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX3P78415 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX3P78415 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX3P78415 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX3P78415 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX3P78415 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX3P78415 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX3P78415 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX3P78415 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX3P78415 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX3P78415 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX3P78415 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX3P78415 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX3P78415 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX3P78415 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX3P78415 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX3P78415 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX3P78415 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX3P78415 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX3P78415 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX3P78415 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX3P78415 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX3P78415 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX3P78415 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX3P78415 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX3P78415 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX3P78415 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX3P78415 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX3P78415 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX3P78415 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX3P78415 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX3P78415 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX3P78415 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX3P78415 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX3P78415 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX3P78415 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX3P78415 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX3P78415 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX3P78415 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX3P78415 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX3P78415 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX3P78415 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX3P78415 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX3P78415 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX3P78415 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX3P78415 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX3P78415 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX3P78415 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX3P78415 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX3P78415 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX3P78415 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX3P78415 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX3P78415 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX3P78415 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX3P78415 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX3P78415 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX3P78415 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX3P78415 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX3P78415 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX3P78415 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX3P78415 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX3P78415 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX3P78415 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX3P78415 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX3P78415 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX3P78415 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX3P78415 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX3P78415 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX3P78415 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX3P78415 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX3P78415 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX3P78415 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX3P78415 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms