Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP1P63208 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP1P63208 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP1P63208 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP1P63208 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP1P63208 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP1P63208 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP1P63208 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP1P63208 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP1P63208 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP1P63208 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP1P63208 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP1P63208 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP1P63208 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP1P63208 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKP1P63208 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKP1P63208 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SKP1P63208 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKP1P63208 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SKP1P63208 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKP1P63208 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKP1P63208 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SKP1P63208 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP1P63208 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP1P63208 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP1P63208 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP1P63208 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP1P63208 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP1P63208 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP1P63208 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP1P63208 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP1P63208 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP1P63208 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP1P63208 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP1P63208 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP1P63208 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP1P63208 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP1P63208 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP1P63208 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP1P63208 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP1P63208 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SKP1P63208 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP1P63208 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP1P63208 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP1P63208 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP1P63208 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP1P63208 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP1P63208 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP1P63208 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP1P63208 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP1P63208 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP1P63208 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP1P63208 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP1P63208 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP1P63208 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP1P63208 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP1P63208 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP1P63208 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP1P63208 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP1P63208 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP1P63208 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP1P63208 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP1P63208 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP1P63208 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP1P63208 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP1P63208 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SKP1P63208 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SKP1P63208 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SKP1P63208 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms