Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVS71-1P61550 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms