Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARF3P61204 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARF3P61204 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARF3P61204 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF3P61204 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF3P61204 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF3P61204 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF3P61204 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF3P61204 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF3P61204 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF3P61204 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF3P61204 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF3P61204 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF3P61204 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF3P61204 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF3P61204 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF3P61204 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF3P61204 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF3P61204 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF3P61204 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF3P61204 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF3P61204 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF3P61204 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF3P61204 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF3P61204 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARF3P61204 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARF3P61204 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARF3P61204 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARF3P61204 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
ARF3P61204 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ARF3P61204 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms