Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNAP25P60880 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAP25P60880 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms