Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARFIP2P53365 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms