Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms