Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLK1P49759 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLK1P49759 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLK1P49759 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLK1P49759 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLK1P49759 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLK1P49759 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLK1P49759 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLK1P49759 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLK1P49759 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLK1P49759 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLK1P49759 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLK1P49759 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLK1P49759 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLK1P49759 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLK1P49759 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLK1P49759 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLK1P49759 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLK1P49759 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLK1P49759 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLK1P49759 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLK1P49759 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLK1P49759 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLK1P49759 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLK1P49759 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLK1P49759 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLK1P49759 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLK1P49759 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLK1P49759 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLK1P49759 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLK1P49759 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLK1P49759 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLK1P49759 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLK1P49759 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLK1P49759 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLK1P49759 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLK1P49759 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLK1P49759 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLK1P49759 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLK1P49759 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLK1P49759 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLK1P49759 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLK1P49759 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLK1P49759 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLK1P49759 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLK1P49759 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLK1P49759 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLK1P49759 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLK1P49759 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLK1P49759 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLK1P49759 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLK1P49759 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLK1P49759 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLK1P49759 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CLK1P49759 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLK1P49759 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLK1P49759 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLK1P49759 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLK1P49759 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLK1P49759 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLK1P49759 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLK1P49759 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLK1P49759 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLK1P49759 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLK1P49759 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLK1P49759 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLK1P49759 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLK1P49759 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLK1P49759 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLK1P49759 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLK1P49759 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLK1P49759 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLK1P49759 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLK1P49759 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLK1P49759 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLK1P49759 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLK1P49759 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms