Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTBP49356 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTBP49356 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTBP49356 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTBP49356 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTBP49356 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTBP49356 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTBP49356 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTBP49356 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTBP49356 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTBP49356 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FNTBP49356 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FNTBP49356 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FNTBP49356 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FNTBP49356 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FNTBP49356 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FNTBP49356 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FNTBP49356 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FNTBP49356 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
FNTBP49356 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FNTBP49356 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNTBP49356 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FNTBP49356 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNTBP49356 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNTBP49356 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FNTBP49356 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNTBP49356 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FNTBP49356 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FNTBP49356 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FNTBP49356 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FNTBP49356 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FNTBP49356 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FNTBP49356 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FNTBP49356 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FNTBP49356 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNTBP49356 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FNTBP49356 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FNTBP49356 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNTBP49356 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FNTBP49356 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FNTBP49356 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTBP49356 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FNTBP49356 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms