Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPZBP47756 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPZBP47756 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms